MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 plasmid pMAR2

Total Repeats: 1456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011603	TCC	2	6	284	289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	215276193
2	NC_011603	GAA	2	6	385	390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276193
3	NC_011603	A	8	8	395	402	100 %	0 %	0 %	0 %	215276193
4	NC_011603	GAA	2	6	428	433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276193
5	NC_011603	TC	3	6	446	451	0 %	50 %	0 %	50 %	215276193
6	NC_011603	TGGATA	2	12	498	509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276193
7	NC_011603	ATTC	2	8	536	543	25 %	50 %	0 %	25 %	215276193
8	NC_011603	CAGT	2	8	622	629	25 %	25 %	25 %	25 %	215276193
9	NC_011603	CTCA	2	8	661	668	25 %	25 %	0 %	50 %	215276193
10	NC_011603	CA	3	6	733	738	50 %	0 %	0 %	50 %	215276193
11	NC_011603	TGC	3	9	834	842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276193
12	NC_011603	AG	3	6	904	909	50 %	0 %	50 %	0 %	215276193
13	NC_011603	AGC	2	6	1014	1019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276193
14	NC_011603	CATT	2	8	1081	1088	25 %	50 %	0 %	25 %	215276193
15	NC_011603	CCG	2	6	1090	1095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215276193
16	NC_011603	ATG	2	6	1116	1121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276193
17	NC_011603	GCCA	2	8	1144	1151	25 %	0 %	25 %	50 %	215276193
18	NC_011603	CTC	2	6	1193	1198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	215276193
19	NC_011603	TGA	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276193
20	NC_011603	GTCT	2	8	2683	2690	0 %	50 %	25 %	25 %	215276194
21	NC_011603	TTGA	2	8	2691	2698	25 %	50 %	25 %	0 %	215276194
22	NC_011603	GCTTGC	2	12	2711	2722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276194
23	NC_011603	TAC	2	6	2751	2756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276194
24	NC_011603	ACA	2	6	2916	2921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276194
25	NC_011603	A	7	7	2925	2931	100 %	0 %	0 %	0 %	215276194
26	NC_011603	AACC	2	8	2933	2940	50 %	0 %	0 %	50 %	215276194
27	NC_011603	G	7	7	2946	2952	0 %	0 %	100 %	0 %	215276194
28	NC_011603	CAT	2	6	3109	3114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276194
29	NC_011603	GCT	2	6	3135	3140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276194
30	NC_011603	CTG	2	6	3160	3165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276194
31	NC_011603	T	9	9	3290	3298	0 %	100 %	0 %	0 %	215276195
32	NC_011603	T	6	6	3356	3361	0 %	100 %	0 %	0 %	215276195
33	NC_011603	TAA	2	6	3434	3439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276195
34	NC_011603	TAT	2	6	3497	3502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276195
35	NC_011603	GAT	2	6	3562	3567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276195
36	NC_011603	ACT	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276195
37	NC_011603	TTA	2	6	3617	3622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276195
38	NC_011603	GAA	2	6	3816	3821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276196
39	NC_011603	ACAG	2	8	3859	3866	50 %	0 %	25 %	25 %	215276196
40	NC_011603	TA	3	6	3871	3876	50 %	50 %	0 %	0 %	215276196
41	NC_011603	ATT	2	6	3943	3948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276196
42	NC_011603	TGA	2	6	3975	3980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276196
43	NC_011603	CT	3	6	3985	3990	0 %	50 %	0 %	50 %	215276196
44	NC_011603	A	6	6	4091	4096	100 %	0 %	0 %	0 %	215276196
45	NC_011603	ATC	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276196
46	NC_011603	ATC	2	6	4155	4160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276196
47	NC_011603	GC	3	6	4193	4198	0 %	0 %	50 %	50 %	215276196
48	NC_011603	AGTATA	2	12	4297	4308	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	215276196
49	NC_011603	GGT	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215276196
50	NC_011603	A	6	6	4332	4337	100 %	0 %	0 %	0 %	215276196
51	NC_011603	AGT	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276196
52	NC_011603	TCT	2	6	4537	4542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215276196
53	NC_011603	GAA	2	6	4551	4556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276196
54	NC_011603	AT	3	6	4566	4571	50 %	50 %	0 %	0 %	215276196
55	NC_011603	ACA	2	6	4633	4638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276196
56	NC_011603	CAG	2	6	4644	4649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276196
57	NC_011603	CAA	2	6	4730	4735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276196
58	NC_011603	GTG	2	6	4831	4836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215276196
59	NC_011603	CATCTG	2	12	4838	4849	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	215276196
60	NC_011603	GTCAG	2	10	4860	4869	20 %	20 %	40 %	20 %	215276196
61	NC_011603	TCA	2	6	4936	4941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276196
62	NC_011603	ACA	2	6	4948	4953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276196
63	NC_011603	TGA	2	6	4985	4990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276196
64	NC_011603	TGA	2	6	5010	5015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276196
65	NC_011603	AT	3	6	5021	5026	50 %	50 %	0 %	0 %	215276196
66	NC_011603	TTG	2	6	5057	5062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215276196
67	NC_011603	AAT	2	6	5068	5073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276196
68	NC_011603	GAA	2	6	5193	5198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276196
69	NC_011603	ATT	2	6	5311	5316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276196
70	NC_011603	AAT	2	6	5346	5351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276197
71	NC_011603	TAT	2	6	5395	5400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276197
72	NC_011603	ACA	2	6	5424	5429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276197
73	NC_011603	CTG	2	6	5605	5610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276197
74	NC_011603	GAT	2	6	5685	5690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276197
75	NC_011603	A	7	7	5693	5699	100 %	0 %	0 %	0 %	215276197
76	NC_011603	GAA	2	6	5810	5815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276197
77	NC_011603	TCA	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276197
78	NC_011603	TA	3	6	5893	5898	50 %	50 %	0 %	0 %	215276197
79	NC_011603	GAA	2	6	5946	5951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276197
80	NC_011603	GGGAA	2	10	5992	6001	40 %	0 %	60 %	0 %	215276197
81	NC_011603	ATTC	2	8	6046	6053	25 %	50 %	0 %	25 %	215276197
82	NC_011603	AGC	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276197
83	NC_011603	AT	3	6	6154	6159	50 %	50 %	0 %	0 %	215276197
84	NC_011603	T	6	6	6180	6185	0 %	100 %	0 %	0 %	215276197
85	NC_011603	ATGATA	2	12	6217	6228	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	215276197
86	NC_011603	ATA	2	6	6312	6317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276197
87	NC_011603	CCGT	2	8	6369	6376	0 %	25 %	25 %	50 %	215276197
88	NC_011603	TTTTTC	2	12	6404	6415	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	215276197
89	NC_011603	TTCT	2	8	6448	6455	0 %	75 %	0 %	25 %	215276197
90	NC_011603	T	6	6	6526	6531	0 %	100 %	0 %	0 %	215276197
91	NC_011603	A	7	7	6550	6556	100 %	0 %	0 %	0 %	215276198
92	NC_011603	T	6	6	6567	6572	0 %	100 %	0 %	0 %	215276198
93	NC_011603	TTC	2	6	6582	6587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215276198
94	NC_011603	AGA	2	6	6648	6653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276198
95	NC_011603	AAAT	2	8	6654	6661	75 %	25 %	0 %	0 %	215276198
96	NC_011603	ATG	2	6	6730	6735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276198
97	NC_011603	A	8	8	6777	6784	100 %	0 %	0 %	0 %	215276198
98	NC_011603	A	6	6	6853	6858	100 %	0 %	0 %	0 %	215276198
99	NC_011603	GTGA	2	8	6934	6941	25 %	25 %	50 %	0 %	215276198
100	NC_011603	TAA	2	6	6975	6980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276198
101	NC_011603	AAACA	2	10	7032	7041	80 %	0 %	0 %	20 %	215276199
102	NC_011603	A	6	6	7043	7048	100 %	0 %	0 %	0 %	215276199
103	NC_011603	G	7	7	7108	7114	0 %	0 %	100 %	0 %	215276199
104	NC_011603	TTC	2	6	7179	7184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215276199
105	NC_011603	CAT	2	6	7198	7203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276199
106	NC_011603	CAA	2	6	7229	7234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276199
107	NC_011603	TC	3	6	7303	7308	0 %	50 %	0 %	50 %	215276199
108	NC_011603	AAT	2	6	7321	7326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276199
109	NC_011603	A	6	6	7349	7354	100 %	0 %	0 %	0 %	215276199
110	NC_011603	ATG	2	6	7418	7423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276199
111	NC_011603	TA	3	6	7438	7443	50 %	50 %	0 %	0 %	215276199
112	NC_011603	CAT	2	6	7508	7513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276199
113	NC_011603	TA	3	6	7514	7519	50 %	50 %	0 %	0 %	215276199
114	NC_011603	GAT	2	6	7528	7533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276199
115	NC_011603	GCT	2	6	7567	7572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276199
116	NC_011603	CAT	2	6	7738	7743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276199
117	NC_011603	CAA	2	6	7826	7831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276199
118	NC_011603	A	7	7	7865	7871	100 %	0 %	0 %	0 %	215276199
119	NC_011603	A	6	6	7873	7878	100 %	0 %	0 %	0 %	215276199
120	NC_011603	ACGGC	2	10	7922	7931	20 %	0 %	40 %	40 %	215276199
121	NC_011603	AACG	2	8	7944	7951	50 %	0 %	25 %	25 %	215276199
122	NC_011603	GAA	2	6	7975	7980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276199
123	NC_011603	ATA	2	6	8023	8028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276199
124	NC_011603	CTT	2	6	8065	8070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215276199
125	NC_011603	GCA	2	6	8077	8082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276199
126	NC_011603	CAT	2	6	8105	8110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276199
127	NC_011603	AAT	2	6	8119	8124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276199
128	NC_011603	TCGA	2	8	8138	8145	25 %	25 %	25 %	25 %	215276199
129	NC_011603	AT	3	6	8262	8267	50 %	50 %	0 %	0 %	215276199
130	NC_011603	G	6	6	8278	8283	0 %	0 %	100 %	0 %	215276199
131	NC_011603	AAT	2	6	8304	8309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276199
132	NC_011603	A	6	6	8353	8358	100 %	0 %	0 %	0 %	215276199
133	NC_011603	TGT	2	6	8359	8364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215276199
134	NC_011603	GGTT	2	8	8429	8436	0 %	50 %	50 %	0 %	215276199
135	NC_011603	GCAT	2	8	8505	8512	25 %	25 %	25 %	25 %	215276199
136	NC_011603	AAT	2	6	8520	8525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276199
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265	NC_011603	TATT	2	8	13036	13043	25 %	75 %	0 %	0 %	215276206
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267	NC_011603	TGT	2	6	13094	13099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215276206
268	NC_011603	ATC	2	6	13131	13136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276206
269	NC_011603	ATG	2	6	13168	13173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276206
270	NC_011603	ATC	2	6	13175	13180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276206
271	NC_011603	TAA	2	6	13202	13207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276206
272	NC_011603	ATG	2	6	13228	13233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276206
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299	NC_011603	GCC	2	6	16097	16102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215276208
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391	NC_011603	A	6	6	32902	32907	100 %	0 %	0 %	0 %	215276217
392	NC_011603	CGT	2	6	33215	33220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276218
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396	NC_011603	GCT	2	6	33406	33411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276218
397	NC_011603	ACC	3	9	33428	33436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215276218
398	NC_011603	TGA	2	6	33463	33468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276218
399	NC_011603	ACC	2	6	33479	33484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215276218
400	NC_011603	CG	3	6	33498	33503	0 %	0 %	50 %	50 %	215276218
401	NC_011603	GCT	2	6	33505	33510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276218
402	NC_011603	CAG	2	6	33569	33574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276218
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404	NC_011603	AAAG	2	8	33641	33648	75 %	0 %	25 %	0 %	215276218
405	NC_011603	GCA	2	6	33658	33663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276218
406	NC_011603	CTGT	2	8	33717	33724	0 %	50 %	25 %	25 %	215276218
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416	NC_011603	CTG	2	6	34037	34042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276218
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453	NC_011603	ATAC	2	8	35789	35796	50 %	25 %	0 %	25 %	215276220
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473	NC_011603	TCA	2	6	36877	36882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276221
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480	NC_011603	ACC	2	6	37305	37310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215276222
481	NC_011603	GAC	2	6	37334	37339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276222
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483	NC_011603	CAGC	2	8	37415	37422	25 %	0 %	25 %	50 %	215276222
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500	NC_011603	CAC	2	6	38876	38881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215276222

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